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1965年,弗拉纳根出生在英国苏格兰格拉斯哥,他是家里5个孩子中的第三个。
16岁时,弗拉纳根的父亲抛弃母亲,但是母亲仍然没有放弃对他的教育。
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岩石自养生物(lithoautotroph)是一种从来源于矿物或无机质的还原化合物反应中获取能量的生物。无机自养生物按其能量来源的不同分为两种类型:从阳光中获取能量的光合自养生物(photolithoautotrophs)和从化学反应中攫取能量的化能自养生物(chemolithoautotrophs)。化能自养生物全都是微生物,而光合自养生物包括大型植物区系(macroflora)如植物,它们不具备将还原化合物的矿物资源转化为能量的能力。大多数化能自养生物属于细菌域,而一些为古菌域。岩石自养细菌在能量释放反应中只能使用无机分子作为基质。术语“无机营养型”(Lithotrop)来自希腊语“lithos”(λίθος)意为“岩石”,而“trōphos”(τροφοσ)意为“消耗者”;从字面上看,它可被解读为“食石者”,名称中的“无机营养型”(lithotroph)字段指的是这些生物体使用无机元素/化合物作为电子源,而“自养”(autotroph)字段指的是它们的碳源是二氧化碳(CO2)许多岩石自养生物都为嗜极微生物,但并非普遍如此,有些可能是酸性矿山废水所导致。
岩石自养生物在其还原化合物来源方面极为特殊,因此,尽管岩石自养生物作为一类群体在使用无机化合物方面呈现出多样性,但一种特定的岩石自养生物只会利用一种类型的无机分子来获取能量。一则化学能自养的示例是浮霉菌门厌氧氨氧化菌(ANAMMOX),它使用亚硝酸根将氨离子氧化为氮气(N2)。此外,在2020年7月,研究人员报告了在进行无关实验后发现的以金属锰为食的化能自养菌培养物,并将该菌种命名为“候选者锰营养型结节状菌”(Candidatus Manganitrophus noduliformans)和“拉姆利氏岩石自养杆菌”(Ramlibacter lithotrophicus)。
一些化能无机自养生物使用氧化还原半反应进行新陈代谢,还原电位较低,这意味着与使用有机营养途径的生物体相比,它们不会获得很多能量,这导致一些化能无机营养因子,如“亚硝基单胞菌”,无法直接降低烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,即“辅酶Ⅰ”(NAD+)。因此,这些生物体依靠反向电子传递来减少辅酶Ⅰ,形成还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)和氢离子(H)。
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