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分子生态学中可以使用很多基因进行研究，在分类学角度，最常应用的基因是核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)。而功能性基因的研究有助于判断微生物在该环境中的活动。

微生物生态学中和分子技术相关的一个重要问题就是，这些生物以主动（进行正常代谢和繁殖）还是被动（静息休眠）的方式存在。这可以用几种方式来解决：

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* 若昂·卡费·菲略（João Café Filho）：巴西政治家、记者和联邦议员，1950年当选副总统。

* 若昂·贝尔纳多·维埃拉（João Bernardo Vieira）几内亚比绍电工、政治家，曾任几内亚比绍总理和几内亚比绍总统，2005年10月1日第三次当选总统。

粤语地区会把若昂译成祖奥，下列是名称为若昂的足球运动员：

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