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大肠杆菌（学名：Escherichia coli，通常简写：E. coli）Wells是肠杆菌科埃希氏菌属的一个物种，为人和动物肠道中的一种细菌，主要寄生于大肠内而得名，约占肠道菌中的0.1%。
大肠杆菌是一种两端钝圆、能运动、无芽孢的革兰氏阴性、兼性厌氧、杆状、大肠埃希氏菌属细菌，常见于小肠下部的温血生物。大多数大肠杆菌的菌株是无害的，但某些血清型（EPEC、ETEC等）会在其宿主中引起严重的食物中毒，并且偶尔会导致产品召回的食品污染事件。无害的菌株是人体肠道中正常菌丛的一部份，会制造维他命K、防止肠道中其他致病菌的生长，对人体有益。大肠杆菌经常透过粪便排放而散布到环境中，它们会在新鲜的粪便且氧气充足的环境中大量孳生约3天，之后菌数就会下降。
这种细菌可以在实验室环境中轻松、廉价地生长和培养，并且已经进行了 60 多年的深入研究。大肠杆菌是一种化学营养型，其化学成分确定的培养基必须包含碳源和能源。大肠杆菌是研究最广泛的原核模式生物，也是生物技术和微生物学领域的重要物种，在重组 DNA的大部分工作中，它都是宿主生物。在有利的条件下，复制只需 20 分钟。
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