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更新于 2026-10-10

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PICRUSt 是一个生物信息学软件包。 该名称是“Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States”(隐性状态重建进行菌群进化研究) 的缩写。

该工具可用于宏基因组分析领域,该工具可基于一个或多个样本的标记基因调查推断微生物群落的功能概况。 PICRUSt 本质上使用了用户提供的OTU表,该表代表标记基因序列(最常见的是16S 簇 )及其在每个样本中的相对丰度。 PICRUSt的输出是按功能基因计数矩阵进行抽样的样本,给出每个研究样本中的功能基因计数。 PICRUSt估计指定样品的能基因谱的能力取决于一组已知的测序基因组 。 这也可以被认为是使用自动化代替手动研究可能存在于16S核糖体RNA 扩增子文库中序列生物体中存在的基因家族。

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乡道投36线(名山路一段)是赤水至中山的道路,其东侧端点位于本地区中部偏北的县道139乙线路口。由此向西北微南直行,出境后可前往下新厝南端、顶新厝北部、赤水并止于县道139乙线路口;向东南可前往名间市区西北郊并止于县道139乙线另一路口。

乡道投40线(下埔巷)是湳子埔至埔中的道路,其东侧端点位于本地区西部的县道139乙线路口。由此向南南东转西再转南南东再转西再转西南蜿蜒而行,出境后可前往炭寮西北部、炭寮与松柏坑交界地带、松柏坑与顶新厝交界地带、松柏坑南部的埔中聚落并止于乡道投42线路口。

乡道投42线(董门巷)是松柏坑至名间的道路,其东侧端点位于本地区中部偏东南东的省道台3线路口。由此向西南微北蜿蜒而行,出境后可前往炭寮、松柏坑并止于其聚落东南侧的县道139乙线路口。

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